Avogadro
Avogadro
adalah grafis molekul dan sistem pemodelan ditargetkan pada molekul dan
biomolekul. Hal ini dapat memvisualisasikan sifat seperti orbital
molekul atau elektrostatik potensi dan fitur pembangun molekul intuitif.
Fitur termasuk:
- Molekul modeller dengan otomatis gaya-bidang optimasi geometri berbasis
- Mekanika Molekul termasuk kendala dan pencarian conformer
- Visualisasi orbital molekul dan isosurfaces (permukaan iso) umum
- Visualisasi getaran dan merencanakan spektrum getaran
- Dukungan untuk sel unit kristalografi
- Masukan generasi untuk Gaussian, GAMESS dan MOLPRO kimia kuantum paket
- Fleksibel Plugin arsitektur dan Python scripting
sel unit cristalograpik
penyumbang terdepan dari tabung nano karbon
pita protein
struktur kedua protein
orbital molekul Benzena dari perhitungan Gaussian
komputasi elektrostatik permukaan potensial
gambar interaktif dari jaringan ikatan hidrogen
Kelebihan pogram avogadro adalah Format file Avogadro dapat membaca termasuk PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, serta Gaussian, GAMESS dan output MOLPRO.
Cara menginstal Avogadro dapat digunakan 2 cara, yaitu dengan melalui Terminal dan melalui Synaptic
1. Penginstalan Avogadro melalui terminal dapat dilakukan dengan arahan sudo apt-get update [Enter]
2. Setelah masuk pada admin pengguna, dapat mengetik sudo apt-get install Avogadro[Enter]
3. Selalu ingat untuk menghubungkan pada internet / LAN jika akan menginstal aplikasi pada Linux
Penginstalan pada Synaptic dapat dilakukan dengan memilih menu Synaptic Package Manager atau menu Synaptic pada Desktop
1. Cari program Avogadro pada menu search
2. Pada
menu program Avogadro, jika belum berwarna hijau, maka Avogadro anda
belum aktif, untuk itu harus diaktifkan dengan cara memilih menu mark
all upgrades untuk menginstal semua aplikasi didalam Avogadro.
3. Lalu pilih menu apply untuk menginstal program
4. Tunggu sampai file semua terinstal
5. Program Avogadro telah menjadi milik anda.
0 komentar:
Posting Komentar